1911年

· 6月8日，由台北开往嘉义的混合列车，下午1时左右行经纵贯线红毛田停车场（今竹北站）北方的凤山溪桥时，第3节车厢（头等二等合造车）不明原因坠桥，造成至少5名日籍乘客死亡，这也是台湾铁道史上首次重大伤亡事故。

1918年

· 6月21日，周日晚间，纵贯线莺歌石—桃仔园间路线因莺歌坡坡度过陡，发生列车溜逸倒退冲进莺歌石驿月台的重大事故，共造成13人死亡。

1948年

· 5月28日，纵贯线新店溪桥上火车车厢因故起火，造成21人死亡，另有43人推定死亡，此事件为2021年太鲁阁事故发生前台湾铁道史上死伤最严重的事故。

1957年

· 12月9日，15时40分前后，纵贯线桃园—莺歌段发生北上22次（台南─基隆）普通列车出轨翻覆。事故起因为孩童于轨道上嬉戏并堆叠道碴（铁轨下所铺碎石）。共造成18人死亡（含司机员当场殉职），116人轻重伤。事故列车本务机为CT271蒸汽机车。此次事故也成为台铁日后宣导“不要在铁路上堆叠石头”的滥觞及案例。

1961年

· 3月11日，基隆开往高雄3001次柴油特快车在纵贯线林凤营与隆田间撞上闯越平交道、载有中华民国陆军士兵的军用卡车，造成卡车上中华民国国军官兵27死12伤，火车上2名乘客受伤，DR2601、2607受损。

· 7月9日，台中开往高雄11次对号特快车在纵贯线民雄站南方撞上闯越平交道的嘉义客运北港开往嘉义班车，造成嘉义客运车上48死28伤，火车司机轻伤。

1963年

· 9月11日，611次货物列车于纵贯线新竹—竹北间乌树林溪桥（今头前溪桥南半段，北半段则为红毛田溪桥），因葛乐礼台风来袭，溪水暴涨，造成该桥严重倾斜，列车掉入河底，二名驾驶以及列车长殉职，事故机车R50号后来被挖回修复并使用至2008年退役。

1964年

· 6月24日，新竹→台北3802次试运转柴油车接近台北市延平北路北门平交道时，因人车拥挤栅栏放下时无法净空，使3802次撞上公车处17路公车（车号：15-00759）并波及一旁人车，造成3死31伤。

1970年

· 2月12日，8次观光号列车(本务机R119号柴电机车)于新竹站北追撞因故障号志灯停车之38次平快车，观光号司机员殉职，共10人死亡，47人受伤。

1971年

· 11月5日，2003次光华号于嘉义车站北方博爱路平交道，因与闯越之卡车冲撞，共3人死亡，32人受伤。

· 11月24日，622次货物列车与63次平快车于纵贯线二水站因货物列车调车失误，造成与进站中的客运列车边撞，共44人受伤。

1973年

· 5月11日，1892次货柜列车(本务机R132号柴电机车)与63次平快车于纵贯线二水站北方，因货柜列车紧轫失效，造成与进站中的客运列车边撞，共12人死亡，40人受伤，客运列车2辆损毁，约11时后排除。

· 10月11日，台中慈安托儿车闯越平交道遭莒光号撞击，3孩童死亡14人受伤。

· 11月4日，383次客运列车与386B次柴油车于淡水线北投站，因副站长及客运列车长并未完成调车确认，造成与柴油车边撞，柴油车司机员殉职，旅客则有一人死亡、10人受伤。

1976年

· 4月21日，南下33次观光号于彰化县大村车站南方过沟平交道，撞上闯越平交道之彰化客运大村国中学生专车，共41人死亡，41人轻重伤。事后大村乡建立淑女祠纪念其中16名女学生。

· 5月30日，北上56次对号快车与南下107次平快车于海线铁路谈文附近，因56次对号快车司机员疑似冒进号志(闯越谈文站副正线上行出发号志机)，导致107次平快车在谈文站北下行第一闭塞号志机前(险阻号志)停车，进而造成56次对号快车与107次平快车迎面对撞，共29人死亡，141人受伤，R112、R116号柴电机车及六辆车厢损毁。

1977年

· 3月17日，三人共骑机车闯越六块厝站，三人死亡.

· 10月24日，第1820次货物列车行至纵贯线路竹—大湖间第三种平交道时，与抢越该平交道之小客车相撞，造成客车上乘客三人死亡。

1978年

· 3月27日，彰化站北方苦苓脚平交道(后改称泰和路平交道)，客货两用汽车驾驶闯越平交道，1281次机车撞及尾部肇致驾驶一人死亡，旅客18人轻重伤。

· 5月13日，北上2002次光华号于台中县沙鹿镇中栖路平交道撞上抢越平交道的砂石车，使砂石车被撞成两半，并造成砂石车司机死亡，火车乘客31人受伤。

· 11月10日，因纵贯线电气化施工，自动号志暂时停用，后壁站轨道转辙改采人工操作，但转辙工黄永和未将转辙器扳转至正确位置，导致4005次南下行李专车误驶上行线（西正线），并于清晨6:35分于大雾中在后壁—新营间与北上202次普通车对撞，普通车查票员蔡伯勋死亡，两列车之司机员、司机助理、铁路员工及乘客合计28人轻重伤（另一说为25人受伤）。

1979年

· 3月16日，本线35次柴油快车在K120+058处与卡车相撞肇致旅客24人受轻重伤。

· 10月1日，0:11分（本时间为当时采行之日光节约时间，国家标准时间为9月30日23:11分），南下1009次自强号于纵贯线左营冒进号志，追撞641次货列，造成13重伤（包含自强号机车长）7轻伤（包含自强号列车长）。

· 10月28日，台东线26次对号快与卡车发生车祸，3死42伤。

1981年

· 3月8日星期日，北上1002次EMU100自强号于纵贯线新竹—竹北间头前溪桥南方，撞上闯越平交道的荧琦货运公司砂石车，砂石车被火车一路推挤，撞上铁桥后砂石车及火车前四节车厢从桥上翻落河床，第五节车厢车头朝下斜靠桥梁及河床间。此事故造成砂石车司机死亡，列车乘客30人死亡，130人轻重伤，40ED110报废，每名乘客发给赔偿金新台币45万元，台铁损失余1亿3千多万元，从此自强号电联车均涂有红色警示漆，平交道的问题也在此事故后进行改善。

· 6月13日，因海线铁路后龙平交道连姓看栅工疏失，铁牛车遭列车撞击，造成3死。

· 9月12日，新竹县一小货车闯越平交道遭自强号撞击，造成10死2伤。

1982年

· 1月26日，北回线南下135次对号特快车于南澳隧道内，因乘客放置炸药自杀，造成最后一节车厢(35SPK32710)爆炸，断成两截共4人死亡。

1984年

· 6月17日，行人4人贪图捷径爬越海线铁路大甲站南端西侧护路水泥栏杆，闯入路线，当场3人死亡。

1985年

· 5月9日，桃园市桃莺路平交道发生因大货车违规闯越铁路平交道栅栏而与列车撞击的事故，造成22人轻重伤。事故后平交道封闭，改建车用陆桥（春日陆桥）。

· 9月1日，东干线北上48次莒光号，由台东经由台北往高雄途中，行经双溪时，疑似因为纵火，造成第七节车厢起火，共3人在事故中死亡。

1987年

· 9月29日，北上26次莒光号（本务机E224）于纵贯线左营撞上调车中的中国石油公司二甲苯罐车列车（可能因调车作业失误或左营站副站长误下指令，造成中油罐车侵入正线而被莒光号撞击），造成25人轻重伤（人数为有送医且有医疗记录者），事故后莒光号40FP10014、35SP32724报废除籍。

1989年

· 12月26日，山线铁路乌日—台中间平交道遭卡车侵入撞击，导致1014次自强号列车车厢内旅客共57人受伤。

1990年

· 4月24日深夜，由高雄北上开往基隆的30次莒光号行经苗栗县造桥隧道时，受当时中部地区连日豪大雨的影响，造成路基旁边坡土石松动滑落而掩埋轨道，机车头刹车不及擦撞隧道南口，造成2人死亡（司机员、助理当场殉职），第10车、9车共11名乘客轻重伤。事故当天台铁山线全线停摆，所有列车改经海线行驶，直至隔日中午才抢通。事故后机车头E221、莒光号车厢SP32627报废除籍。

· 9月26日，181B次普通车在东港线镇安—东港间因台汽客运国光号MCI大客车疑似闯越平交道，造成冲撞，共5人死亡30人受伤。

· 10月8日，屏东线高港起公里475米平交通处重大交通事故造成3人死亡

· 12月20日，北上1020次EMU300（EMU306）自强号于路竹—大湖间西部干线K374＋410米处，因游览车欲载客进入大仁路平交道旁巷道内之饲料工厂，在平交道倒车，造成冲撞，导致游览车起火燃烧，自强号列车车厢损毁，电车线杆断损，自强号旅客7人受伤，游览车乘客25人死亡、27人轻重伤。事后游览车司机与负责指挥游览车倒车者均被依业务过失致死罪起诉判刑。

1991年

· 10月30日，12时40分，内湾线竹东站停放之10节水泥重车因强风吹袭加上刹车失效往站外溜逸，即使副站长等三人跳上车试图以手轫机刹车，仍因路段下坡和车辆太重而徒劳无功。此时，由新竹开往内湾的3149次柴油客车进站，两列车便在竹林大桥（ 县道123号跨越头前溪之桥梁）下相撞，造成14人（含柴客司机）轻重伤，事故后DR2402柴油客车报废除籍。

· 11月15日，南下1次莒光号于134号志站（旧山线）正转辙轨道进入副线当中交会列车，因当时设置于北上1006次EMU100型自强号机车端的ATS／ATW系统故障(而于高雄站出发时于列车编组尾端加挂E224辅助机车行驶)，导致自强号列车边撞莒光号还没开入副线的第7车，莒光号第7~9车及自强号第8~10车翻覆，导致两列车上旅客共30死112伤;事故后自强号ED102、ET101与莒光号FPK10207、FPK10209报废除籍，每位旅客赔偿3百万元，时任铁路局长陈世芳以及自强号司机员苏金焜皆被以业务过失致死罪起诉。司机员苏金焜被判刑四年有期徒刑。

1992年

· 10月31日，北上1010次自强号于旧山线胜兴—三义间八股头平交道，因拖车进退不得，造成列车紧轫不及与大拖车冲撞，共86人受伤，事故后EM211、EP211报废除籍。

1993年

· 11月26日，南下自强号于新营，因遭空载混凝土车辆冲撞第2辆与第3辆车厢间，造成列车出轨及混凝土车裂成两半，共3人死亡15人伤。

1994年

· 3月18日，北上1008次EMU100自强号于海线铁路大肚—龙井间顶街平交道，因货运卡车闯越平交道冲撞，造成前3节车厢出轨，ED108报废，机车长及督导员在内共9人死亡，24人轻重伤，事后该处平交道改建立体化后消失（即今万兴陆桥）。

1997年

· 3月27日，一列由树林开往苏澳的1083次自强号(编组DR3045-3093-3046=DR3039-3090-3040)，由于宜兰线外澳站当时有一部水泥高压泵浦车于站内从事边坡工程时，不慎侵入铁轨净空，导致列车进站时遭迎面撞上，造成水泥高压泵浦车司机死亡，列车因翻覆造成车上20余人轻重伤；事故后DR3045、DR3093报废除籍。

· 4月3日，正当清明节连续假期的返乡高峰期，一列由高雄发车的1012次自强号，在18时49分行经台中县乌日乡（今台中市乌日区）学田路平交道（今新乌日站南方）时，撞上一辆卡在平交道上动弹不得的砂石车，造成砂石车司机和列车随车机务员2人死亡，60余人轻重伤，事故后EM209报废除籍。

1998年

· 5月25日，11次莒光号于纵贯线隆田—善化间东势寮，该路段路线养护抽换枕木拆除连续两枕木之钢轨扣件，恰巧本务机次位尚有无火回送电力机车乙辆，连续两辆电力机车通过致无扣件之轨道无法承受重量而造成轨道挫曲，莒光号2辆车厢出轨，共29人受伤，事后台铁检讨并修正工务相关规章，更换枕木不得拆除连续两枕木之扣件。

2001年

· 3月12日，数节载运钢轨之平板货车于山线铁路丰原办理调车，因调车机轫机无法煞停整列车，地势关系，一路往南溜逸，采行紧急调度，将列车溜逸至台中车站安全侧线，于台中市民生路建国路口翻覆，造成铁轨钢条滚落桥下波及民宅1间、公路车辆20辆，共3人死亡，4人受伤，死者包含货运公司及铁路局员工，事故后DL-1025调动机与35F20023、35F20025、35F20054、35F20100、35F20107等5辆平车报废除籍。

· 7月13日，41次莒光号于苗栗县造桥乡南港溪桥，因路线养护未立即填补道碴横压减弱轨道挫曲，造成10节车厢列车的机车及8辆车厢出轨，其中3～7车倾覆桥上，共造成43人受伤，事故后SP32861、SP32864、SP32979、FP10051、FP10108等5辆莒光号车厢报废除籍。

2002年

· 7月20日，上午9时5分许，1009次南下自强号列车行经纵贯线莺歌镇东莺里平交道时撞上一部满载Ｈ型钢梁拖板车，导致本务机E1013端面严重受损，而钢梁扫断两根高压电杆，并波及铁路旁民宅、汽车；拖板车司机死亡、列车乘客共16人轻重伤。

2003年

· 10月14日，一列由基隆开往新竹的2507次通勤电联车于纵贯线莺歌镇东莺里平交道，撞击因拖板车挡道而停留在平交道上之新北市立育林国民中学毕业旅行游览车，造成游览车上4名学生死亡，37人轻重伤，EM603、ET603端面受损，事故后平交道附近道路被拓宽。

2005年

· 6月21日深夜，由高雄开往台东的2057次自强号，在行经加禄=内狮间时，疑似铁轨遭到人为破坏，导致整列车共6节车厢出轨倾斜，车上共15名旅客受伤、近百位乘客受困。后被证实是台铁南回线连续破坏事件相关事故之一。

2006年

· 3月10日深夜，由树林站开往花莲站的1073次自强号，因北回线部分路段进行道碴养护故改行驶西正线，在无预警的状况下行经崇德站南端（北回线58k+100处）时，高速撞击5名进行轨道电路维修之道班工与电务工，5人当场殉职。主因为相关人员未能确切遵循规章且未做防护措施，事发后局长徐达文下台负责，相关人员遭到连坐处分，一年后立碑纪念。

2007年

·  6月15日，北上3902次试运转列车(编组E403＋E308)于宜兰线大溪—大里间，因机车长以ATP故障为由未启用且冒进号志，造成与待避1079次自强号后正要转辙出站的南下2719次区间车（编组EMU508）于大里站南侧横渡线发生边撞，造成车上5名乘客死亡、17人受伤，事故发生当日及次日宜兰线与北回线的列车运转混乱；事故后EMU508整组报废，其事故车厢(EP508+ET508)于2020年6月3、4日标售后已拆解完毕。

2012年

· 1月17日上午8时42分，由田中开往花莲的278次太鲁阁列车，行经纵贯线埔心车站南侧之幸福水泥厂平交道时撞上闯越平交道的砂石车，并将砂石车车斗推行约500米后于埔心车站内出轨，造成列车前三节(40TED1010、40TEM1019、45TEP1010)出轨、车头40TED1010经撞击后全毁，铁轨被扯断，电车线杆也遭撞断，导致纵贯线南北双向全部中断，事故造成司机员蔡崇辉不幸殉职，22名旅客受伤（其中1名重伤、21名轻伤），事故编组TEMU1009+1010则到2015年初才完成修复。

2013年

· 8月31日上午7时26分，由台东开往新左营的302次自强号(编组DR3051-3096-3052=DR3003-3072-3004)行经南回线枋野—枋山间的枋山二号隧道东口外时撞击土石流，导致列车车厢脱轨分离10米，造成乘客17人受伤，其中4人重伤，事故后DR3051-DR3096-DR3052整组报废。

2016年

·  7月7日晚间约10时，一列由新竹开往基隆的1258次区间车(编组EM509+EM504)，在进入松山车站月台前，第6车45EP509行李架上之行李箱发生爆炸，造成25名旅客受伤。

2018年

· 10月21日，由树林开往台东的6432次普悠玛列车(编组TEMU2007+TEMU2008)，于下午约4时50分时行经宜兰线新马站前弯道时以时速141公里高速出轨，8节车厢全数出轨，其中第3、5、7、8节车厢翻覆，造成18名乘客死亡、215人轻重伤。事故编组因受损严重将在调查完毕后报废除籍，成为第一组因事故而全列报废的倾斜式列车。

2021年

· 4月2日，清明节连假首日，由树林开往台东的408次太鲁阁列车(列车编组TEMU1013+TEMU1014)，于上午9点多行经北回线花莲县秀林乡和仁—崇德间清水隧道前(51K+250)，撞上从隧道上方滑落施作明隧道工程的工程车，导致列车出轨、5至8车厢高速撞入隧道而严重变形，现场十分惨烈。这班太鲁阁号共8节车厢，包含站票在内乘客约500人，台铁最新公布50人死亡（包含司机员袁淳修、助理司机员江沛峰，以及后来发现在第六节车厢的重压遗体）和216人轻重伤。此次事件为台湾铁路管理局营运后最严重之伤亡事故。

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