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产品动态 | STOmics 时空组学产品解决方案更新(4-5月)

八卦谈 佚名 2023-08-06 21:15:50

时空组学产品解决方案4-5月更新内容主要包括:时空试剂产品包装形式、时空试剂产品使用说明书、STOmics® 时空转录组与多重免疫荧光(mIF)共检测技术方案等三部分内容,详细更新信息如下。


时空试剂产品包装形式【优化】


1. Stereo-seq 透化试剂套装(载体版)-201SP118,变更说明:

  • “4+3+1”变更为“4+4”。


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2. Stereo-seq 转录组试剂套装(载体版)-201ST114,变更说明:

  • “2+1+1”变更为“1+1+1+1” ;

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  • 套装内新增一份STOmics Accessory Kit(1000033700)。


时空试剂产品使用说明书【优化】


1. Stereo-seq 透化试剂套装(载体版)使用说明书-A1,变更说明:


适配Stereo-seq透化试剂套装(载体版),201SP118。

  • 芯片载体设计形式变更;

  • 0.1×SSC (含 5% RI)更名为Wash Buffer;

  • 0.01N HCl (pH=2.0 )保存时间由24 hr延长至48 hr;

  • 甲醇预冷时间由10-30 min变更为5-30 min;

  • RT QC Mix用量由90 μL/芯片变更为100 μL/芯片;

  • 格式勘误。

2. Stereo-seq 转录组试剂套装(载体版)使用说明书-A1,变更说明:


适配Stereo-seq 转录组试剂套装(载体版),201ST114。

  • 芯片载体设计形式变更;

  • 0.1×SSC(含 5% RI)更名为Wash Buffer;

  • 0.01N HCl (pH=2.0 )保存时间由24 hr延长至48 hr;

  • 甲醇预冷时间由10-30 min变更为5-30 min;

  • 1×透化试剂工作液用量由100 μL/芯片变更为150 μL/芯片;

  • RT Mix用量由90 μL/芯片变更为100 μL/芯片;

  • cDNA 纯化步骤的QC质控点中,Nuclease-free Water用量由20 μL变更为40 μL;

  • 格式勘误。


STOmics® 时空转录组与多重免疫荧光(mIF)共检测技术方案


通过将同一组织切片的全转录组空间分析与目标蛋白免疫荧光检测相结合,可更深入、更全面地了解组织结构及组织异质性。


1. 试剂产品V1.2

  • 时空转录组与多重免疫荧光(mIF)共检测技术所使用的试剂盒、芯片与常规时空转录组一致。

2. STOmics® 时空转录组与多重免疫荧光(mIF)共检测技术操作指南-A0

  • 含抗体滴定、mIF预实验、透化时间测试及转录组实验等技术流程的标准操作指导。

3. STOmics® 时空组学线下分析解决方案V2

  • ImageStudio v2.0:图像质控新增对于DAPI染色图像和IF染色图像的QC功能;新增基于DAPI图像的IF图像校准功能;新增IF图像区域识别的阈值式组织分割功能;软件输入输出IPR格式版本升级;

  • SAW v6.0:增加rRNA的过滤功能;适配rRNA过滤场景的统计;兼容ImageStudio v1和v2版本各种处理文件及图像输入;支持处理DAPI+IF多图场景;细胞分割支持在DAPI组织分割区域内结合IF阈值以及DAPI进行分割;支持一个染色类型的图分别保存多种不同的配准、组织分割、细胞分割图像;IF场景下聚类图底图增加伪彩色,最多支持7种伪彩;

  • StereoMap v2.0:新增IF蛋白图层展示,cellbin图像及聚类结果展示,手动图像配准等功能。该软件输入文件支持来自于SAW v6.0/ImageStudio v2.0配套的最新版本RPI图像文件、IPR数据文件等。

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